20 Open-source gereedskap kan COVID-19 Cure Research help

Regerings, wetenskaplikes en navorsingsinstellings gebruik tegnologie en innovasie om COVID-19 aan te pak.


Oopbron-instrumente is ontwikkel, en sommige word steeds getoets om die pogings wat gebruik is om die uitkomste van hierdie dodelike virus te verminder, te ondersteun.

Daar is reeds ‘n reeks oopbron-instrumente beskikbaar wat navorsers help om die siekte te leer ken, die verspreiding te identifiseer, die verspreiding te voorkom, en om die verspreiding en sterftes tot die minimum te beperk. ‘N Verskeidenheid projekte is beskikbaar by die Onderwys-ekosisteem wat uiteensit hoe verskillende instrumente gebruik word.

Hierdie artikel kyk na sommige van die open source-instrumente en -biblioteke wat gebruik word in die monitering, voorkoming en inperking, diagnose en behandeling van COVID-19.

COVID-19-opsporingskaart

In Januarie het die JHU se sentrum vir stelselwetenskap en ingenieurswese ‘n COVID-19 Global Tracking Map wat vinnig ‘n internasionaal betroubare bron geword het van die veranderende pandemie se data in real-time.

Die kaart is open source en word gebruik om navorsings- en visualiseringspogings deur top-media-organisasies, klein organisasies en plaaslike regerings te benut.

DXY-COVID-19-Crawler

DXY-COVID-19-Crawler is een van die vroegste open source projekte wat ontwikkel is om in Januarie op COVID-19 te reageer.

Die ontwikkelaars het gebruik gemaak van data van DXY.cn, ‘n webwerf wat deur Chinese mediese praktisyns gebruik is om gevalle aan te meld en op te spoor. Hulle het ‘n webkruiper ontwikkel wat data van die webwerf versamel en beskikbaar gestel het via ‘n API en ‘n datapakhuis. Die kode is beskikbaar op GitHub.

Oop datakit

Oop datakit (ODK) is nie ‘n nuwe instrument nie. Dit is al voorheen gebruik tydens die Ebola-uitbrake in Wes-Afrika in 2004 en die meer onlangse uitbraak in die Demokratiese Republiek van die Kongo in 2019.

Dit help gebruikers veral om data in te samel, te bestuur en te gebruik in kontakopsporing, strategiese kartering, besluitnemingsondersteuning, sensitiwiteit van die gemeenskap en gevallebestuur.

Die ODK-gemeenskap het sy gebruik verder gevorder in reaksie op die COVID-19 deur ‘n verslagvorm in sy ontplooiings beskikbaar te stel. Die vorm is ontwerp volgens die protokol van die Wêreldgesondheidsorganisasie vir die ondersoek van gevalle, kontakopsporing en ondersoeke.

Die hoofontwikkelaars bied ook gratis ondersteuning aan vir enige organisasie wat die ODK in reaksie op COVID-19 ontplooi het.

Nextstrain

Nextstrain hou die evolusie van patogene op. Dit is voorheen gebruik om die familiegeskiedenis van ‘n siekte uit te werk, waardeur die voorspelling van die siektevordering moontlik gemaak word.

Dit is suksesvol gebruik in vorige epidemies, soos Ebola. Via genetiese data van die Global Initiative for Sharing All Influenza Data (Gisaid), word Nextxtrain gebruik om COVID-19 aan te pak.

DHIS2

U weet dit waarskynlik al DHIS2. Dit is die grootste gesondheidsinligtingsbestuurstelsel ter wêreld. Dit word in meer as 70 lande gebruik. As deel van die reaksie op COVID-19 het DHIS2 ‘n digitale datapakket uitgereik wat besmetting, rapportering, toesig en behandeling van die siekte versnel.

Die DHIS2-digitale datapakket maak gebruik van standaardmetadata wat in lyn is met die WGO se protokol oor die definisie en toesig van die COVID-19-saak om vinnige ontplooiing en reaksie moontlik te maak.

Pikobar Wes-Java

Indonesië se inligtings- en koördineringsentrum vir siektes en rampe is ‘n sentrum vir krisisrespons wat gevorm word om COVID-19 in die Wes-Java provinsie van Indonesië te verminder en daarop te reageer.

Die Jabar Digital Service het as deel van die reaksie ‘n oopbron-hulpmiddel en -program waarmee gebruikers toegang tot die nuutste COVID-19-data kan verkry.

OpenMRS

OpenMRS is ‘n pasiëntsorgstelsel wat in baie ontwikkelende lande regoor die wêreld gebruik word. Weens die buigsaamheid van die OpenMRS-stelsel, lande wat hul gesondheidsorgbronne gespanne het, kan dit gebruik vir COVID-19 vir toesig, sifting en behandeling.

Die stelsel kan hulle help om hul kapasiteit uit te brei deur hulle toegang te gee tot wetenskaplik-gebaseerde inligting oor die hantering van die krisis.

OpenLMIS

Die OpenLMIS-projek maak gebruik van ‘n gemeenskapsgerigte taktiek om ‘n open source en ‘n verstelbare inligtingstelsel vir logistieke bestuur te ontwikkel. Die OpenLMIS-stelsel poog om die akkuraatheid van data te verbeter, aanspreeklikheid te verhoog, datatydigheid en sigbaarheid te verbeter.

Die OpenLMIS-stelsel poog om die verskaffingskettings vir gesondheid, die inventaris van mediese hulpbronne te verbeter om ‘n duidelike beeld te gee van die beskikbare mediese voorrade, insluitend toetsstelle, en PPE’s (persoonlike beskermende toerusting). Hierdie instrument kan effektief gebruik word om besluitnemers te ondersteun in die toekenning van hulpbronne as ‘n reaksie op COVID-19.

Healthsites

Die Wêreldplan vir die kartering van gesondheidswerwe is ‘n projek wat daarop gemik is om elke gesondheidsinstansie in die wêreld te karteer en die besonderhede van elke hospitaal maklik toeganklik te maak. Die inligting oor gesondheidsfasiliteite is via ‘n API toeganklik gemaak.

Deur saam te werk met gebruikers, vang en valideer die healthsites.io-span die ligging en kontakbesonderhede van elke gesondheidsfasiliteit en maak die data vrylik beskikbaar en toeganklik via ‘n Open Data License.

SORMAS

SORMAS (Bestuurs- en analise-stelsel vir toesiguitbrake) is ‘n oopbron-mobiele e-gesondheidstelsel. Dit is ontplooi om siektebeheer sowel as prosedures vir die bestuur van uitbrekings te implementeer.

Dit is effektief in verskeie lande, waaronder Ghana, Nigerië, Nepal en Fidji, ontplooi vir COVID-19 toesig en vroeë opsporing.

SORMAS is ‘n gratis open source-stelsel wat aan databeskermstandaarde voldoen.

Tokio COVID-19

Anders as baie ander stede en regerings, is die Tokio Metropolitaanse regering het ‘n open source webwerf ontwikkel wat sy inwoners oor COVID-19 inlig. Deur die open source te maak, het die webwerf bydraes van meer as 200 gebruikers gelewer. Drie ander stede, Chiba, Nagano en Fukuoka, het die webwerf herskep.

OpenELIS

Die doel van die OpenELIS-gesondheidstelsel is om gesondheidsorg te verbeter deur ‘n progressiewe, standaardgebaseerde laboratoriuminligtingbestuurstelsel te voorsien wat deur verskillende gesondheidsinisiatiewe gebruik kan word om behandelingsopsies te verbeter.

Die COVID-19-uitbraak het ‘n wêreldwye uitdaging aangebied om kontakspore en massatoetsing van vermoedelike gevalle op te spoor. Die OpenELIS-stelsel kan effektief gebruik word om COVID-19 aan te pak om die opspoor van laboratoriumtoetse en -resultate te vergemaklik.

Gemeenskapsgesondheidswerktuigkit

Die Gemeenskapsgesondheidswerktuigkit is ‘n versameling van oopbron-gereedskap sowel as oop-toeganghulpbronne wat daarop gemik is om digitale instrumente te bou en te ontplooi vir gebruik in gemeenskapsgesondheidsinisiatiewe in gebiede wat moeilik bereikbaar is.

Die Community Health Toolkit-ontwikkelaarsgemeenskap het gemobiliseer om gereedskap en hulpbronne te ontwikkel wat daarop gemik is om gemeenskapsgesondheidswerkers te ondersteun om COVID-19 aan te pak.

CHIME

Die COVID-19-hospitaalimpakmodel vir epidemies (CHIME) is ‘n open source toepassing wat ontwikkel is deur datawetenskaplikes van Penn Medicine – Universiteit van Pennsylvania. Dit is ‘n aanlynhulpmiddel waarmee hospitale die impak van die virus op gesondheidsorgbronne kan voorspel.

Dit word ontwikkel met behulp van Python en die open source-afhanklikheid van die pandas.

COVID Sorgkaart

Die COVID Sorgkaart help om die reeds bestaande gesondheidsorgbronne te karteer en om gapings in hospitaalbeddens, ventilators, mediese voorrade en personeelvoorspelling te voorspel. Al die metodes, dataverwerkingsinstrumente, visualisering en bronkode is gratis en open source.

Die COVID Care Map-projek poog om te antisipeer en om hulp te verleen om effektief te sorg vir die vinnig groeiende aantal COVID-19-infeksies en diegene wat intensiewe sorg benodig..

Locale.ai

Locale.ai het ‘n open source, interaktiewe visualisering van alle bevestigde gevalle van COVID-19 regoor die wêreld ontwikkel. Dit vra die open source datastel van die John Hopkins Universiteit.

Locale.ai het die COVID-19-visualisasiewebwerf deur die gebruik van Vue.js, wat ‘n gewilde raamwerk is wat ontwikkelaars in staat stel om moderne webapps te skep.

COVID-19 regoor die wêreld

Hierdie app maak gebruik van ‘n kaartvisualisering om die verspreiding van COVID-19, die bevestigde gevalle en die ontwikkeling van die siekte oor die hele wêreld te monitor. Dit maak gebruik van data van John Hopkins CSSE.

Coronavirus spoorsnyer

Dit is ‘n blink app wat ontwikkel is deur John Coene. Dit hou die verspreiding van COVID-19 dop deur die gebruik van data van John Hopkins, DXY-data en Weixin. Die app toon die aantal gevalle wat vermoedelik, bevestig en verhaal is volgens tyd en streek. Die kode is beskikbaar op GitHub.

COVID-19 Globale gevalle

COVID-19 Globale gevalle is ‘n blink app wat ontwikkel is deur Christoph Schoenenberger wat die ontwikkelinge van COVID-19 op ‘n kaart, erwe, opsommingstabelle en figure toon. Die kode is beskikbaar op Github.

Regerings en COVID-19

Dit is ‘n blink app wat ontwikkel is deur Sebastian Engel-Wolf. Dit kaarte die COVID-19 eksponensiële groei, dae tot dubbele infeksies, bevestigde gevalle, sterftesyfer, en die aantal bevestigde gevalle per 100,000 mense in verskillende streke. Die kode is op Github beskikbaar.

Klaar maak

Die oopbron-gemeenskap het vinnig en effektief op die COVID-19-pandemie gereageer. Baie projekte is gebou en word voortgebou om die verspreiding van die siekte aan te pak. Hierdie artikel beskryf sommige van die projekte. Daar is nog onsekerheid oor hoe die siekte in die komende weke sal vorder. Meer projekte wat die bestaande open source tegnologieë kan benut, sal ‘n plek vind in die stryd teen hierdie dodelike siekte.

Bly veilig!

Artikel deur Dr. Michael J. Garbade, uitvoerende hoof, Education Ecosystem

Jeffrey Wilson Administrator
Sorry! The Author has not filled his profile.
follow me
    Like this post? Please share to your friends:
    Adblock
    detector
    map