20 инструментов с открытым исходным кодом могут помочь COVID-19 Cure Research

Правительства, ученые и исследовательские институты используют технологии и инновации для борьбы с COVID-19.


Были разработаны инструменты с открытым исходным кодом, и некоторые из них продолжают тестироваться для поддержки предпринятых усилий по минимизации последствий этого смертельного вируса..

Уже существует целый ряд инструментов с открытым исходным кодом, которые помогают исследователям узнать об этой болезни, выявить ее распространение, предотвратить ее распространение и свести к минимуму дальнейшее распространение и смертность. Ряд проектов доступен на Образовательная экосистема который описывает, как использовать различные инструменты.

В этой статье рассматриваются некоторые инструменты и библиотеки с открытым исходным кодом, которые используются для мониторинга, профилактики и локализации, диагностики и лечения COVID-19..

Карта слежения COVID-19

В январе Центр системной науки и техники при JHU запустил Глобальная карта слежения COVID-19 который быстро стал источником доверия к развивающейся пандемии в режиме реального времени.

Карта имеет открытый исходный код и использовалась для поддержки исследований и визуализации ведущими медиа-организациями, небольшими организациями и местными органами власти..

DXY-COVID-19-Гусеничный

DXY-COVID-19-Crawler – один из первых проектов с открытым исходным кодом, разработанный для ответа на COVID-19 в январе..

Разработчики использовали данные из DXY.cn, сайта, который использовался китайскими врачами для сообщения и отслеживания случаев. Они разработали веб-сканер, который собирал данные с сайта и делал их доступными через API и хранилище данных. Код доступен на Github.

Open Data Kit

Комплект открытых данных (ODK) это не новый инструмент. Ранее он использовался во время вспышек Эболы в Западной Африке в 2004 году и недавней вспышки в Демократической Республике Конго в 2019 году..

Это главным образом помогает пользователям собирать, управлять и использовать данные для отслеживания контактов, стратегического картирования, поддержки принятия решений, информирования сообщества и управления делами..

Сообщество ODK еще больше расширило свое использование в ответ на COVID-19, предоставив в своем развертывании форму отчетности Форма разработана в соответствии с протоколом Всемирной организации здравоохранения для расследования случаев и отслеживания контактов и расследований.

Ведущие разработчики также предлагают бесплатную поддержку для любой организации, которая развернула ODK в ответ на COVID-19.

Nextstrain

Nextstrain отслеживает эволюцию патогенов. Ранее он использовался для выяснения семейного анамнеза заболевания, что позволяет прогнозировать прогрессирование заболевания..

Это успешно использовалось в предыдущих эпидемиях, таких как Эбола. Благодаря генетическим данным Глобальной инициативы по обмену всеми данными о гриппе (Gisaid), Nextxtrain используется для борьбы с COVID-19.

DHIS2

Вы, наверное, уже знаете DHIS2. Это крупнейшая в мире система управления медицинской информацией. Он используется более чем в 70 странах. В рамках ответа на COVID-19 DHIS2 выпустила пакет цифровых данных, который ускоряет обнаружение инфекции, отчетность, наблюдение и лечение заболевания..

В пакете цифровых данных DHIS2 используются стандартные метаданные, которые соответствуют протоколу ВОЗ по определению случаев и эпиднадзору за COVID-19 для обеспечения быстрого развертывания и реагирования.

Пикобар Западная Ява

Индонезийский информационно-координационный центр по болезням и стихийным бедствиям – это центр реагирования на кризисы, созданный для смягчения и реагирования на COVID-19 в провинции Западная Ява в Индонезии.

Jabar Digital Service в рамках ответа разработала веб-инструмент и приложение с открытым исходным кодом что позволяет пользователям получать доступ к последним данным COVID-19.

OpenMRS

OpenMRS – это система ухода за пациентами, используемая во многих развивающихся странах по всему миру. Благодаря гибкости Система OpenMRS, страны, у которых были ограничены ресурсы здравоохранения, могут использовать его для наблюдения, скрининга и лечения COVID-19.

Система может помочь им расширить свои возможности, предоставив им доступ к научной информации о преодолении кризиса..

OpenLMIS

Проект OpenLMIS использует тактику, ориентированную на сообщество, для разработки системы с открытым исходным кодом и гибкой информационной системы управления логистикой. Система OpenLMIS стремится улучшить точность данных, повысить подотчетность, улучшить своевременность данных и видимость.

Система OpenLMIS направлена ​​на улучшение цепочек поставок в области здравоохранения, инвентаризации медицинских ресурсов, чтобы обеспечить четкое представление о доступных медицинских расходных материалах, включая тестовые наборы и СИЗ (средства индивидуальной защиты). Этот инструмент может эффективно использоваться для поддержки лиц, принимающих решения, при распределении ресурсов в ответ на COVID-19..

Healthsites

Глобальный проект карт здравоохранения Это проект, нацеленный на картографирование каждого медицинского учреждения в мире и обеспечение легкого доступа к деталям каждой больницы. Данные о медицинских учреждениях стали доступны через API.

Сотрудничая с пользователями, команда healthsites.io собирает и проверяет местоположение и контактные данные каждого медицинского учреждения, а также делает данные свободно доступными и доступными через лицензию Open Data..

SORMAS

СОРМАС (Система управления и анализа мер реагирования на вспышки) – мобильная система электронного здравоохранения с открытым исходным кодом. Он был развернут для осуществления контроля заболеваний, а также процедур управления вспышками.

Он был эффективно развернут в нескольких странах, включая Гану, Нигерию, Непал и Фиджи, для эпиднадзора за COVID-19 и раннего обнаружения.

SORMAS – это бесплатная система с открытым исходным кодом, соответствующая стандартам защиты данных..

Токио COVID-19

В отличие от многих других городов и правительств, Столичное правительство Токио разработал сайт с открытым исходным кодом, который информирует своих жителей о COVID-19. Сделав его открытым исходным кодом, сайт увидел вклад более 200 пользователей. Три других города, Тиба, Нагано и Фукуока, воссоздали веб-сайт.

OpenELIS

Цель Система Здоровья OpenELIS заключается в улучшении здравоохранения путем предоставления прогрессивной, основанной на стандартах лабораторной системы управления информацией, которая может использоваться различными инициативами в области здравоохранения для улучшения вариантов лечения.

Вспышка COVID-19 представляет собой глобальную проблему отслеживания контактов и массового тестирования подозрительных случаев. Система OpenELIS может эффективно использоваться в решении COVID-19 для облегчения отслеживания лабораторных испытаний и результатов..

Community Health Toolkit

Community Health Toolkit представляет собой набор инструментов с открытым исходным кодом, а также ресурсов открытого доступа, предназначенных для создания и развертывания цифровых инструментов для использования в инициативах общественного здравоохранения в областях, которые труднодоступны.

Сообщество разработчиков Community Health Toolkit мобилизовало усилия для разработки инструментов и ресурсов, направленных на оказание поддержки работникам общественного здравоохранения в борьбе с COVID-19..

ЗВОНОК

COVID-19 Больничная модель воздействия на эпидемии (CHIME) – это приложение с открытым исходным кодом, разработанное учеными-данными из Penn Medicine – Пенсильванского университета. Это онлайн-инструмент, который позволяет больницам прогнозировать влияние вируса на ресурсы здравоохранения..

Он разработан с использованием Python и зависимости от открытого исходного кода Pandas..

COVID Care Карта

COVID Care Карта помогает в картировании уже существующих ресурсов здравоохранения и в прогнозировании пробелов в больничных койках, вентиляторах, медикаментах и ​​персонале. Все методы, инструменты обработки данных, визуализации и исходный код являются бесплатными и с открытым исходным кодом..

Проект «Карта помощи COVID» направлен на прогнозирование и принятие мер по оказанию поддержки для эффективного лечения быстро растущего числа инфекций COVID-19 и лиц, нуждающихся в интенсивной терапии..

Locale.ai

Locale.ai разработал интерактивную визуализацию с открытым исходным кодом всех подтвержденных случаев COVID-19 по всему миру. Он запрашивает набор данных с открытым исходным кодом из Университета Джона Хопкинса.

Locale.ai разработал Сайт визуализации COVID-19 с помощью Vue.js, популярного фреймворка, который позволяет разработчикам создавать современные веб-приложения.

COVID-19 по всему миру

Это приложение использует визуализацию карты для мониторинга распространения COVID-19, подтвержденных случаев и развития заболевания по всему миру. Он использует данные из CSSE Джона Хопкинса.

Коронавирусный трекер

Это блестящее приложение, разработанное Джоном Коеном. Он отслеживает распространение COVID-19 с использованием данных Джона Хопкинса, данных DXY и Weixin. Приложение показывает количество подозреваемых, подтвержденных и восстановленных случаев по времени и региону. Код доступен на Github.

COVID-19 Глобальные случаи

COVID-19 Глобальные случаи это блестящее приложение, разработанное Кристофом Шененбергером, которое показывает развитие COVID-19 на карте, графиках, сводных таблицах и рисунках. Его код доступен на Github.

Правительства и COVID-19

Это блестящее приложение, разработанное Себастьян Энгель-Вольф. Он отображает экспоненциальный рост COVID-19, число дней до удвоения числа инфекций, количество подтвержденных случаев, уровень смертности и количество подтвержденных случаев на 100 000 человек в разных регионах. Код доступен на Github.

Завершение

Сообщество открытого кода быстро и эффективно отреагировало на пандемию COVID-19. Многие проекты были построены и продолжают строиться для борьбы с распространением болезни. В этой статье описываются некоторые проекты. До сих пор неясно, как болезнь будет прогрессировать в ближайшие недели. Больше проектов, которые могут использовать существующие технологии с открытым исходным кодом, найдут место в борьбе с этой смертельной болезнью.

Оставаться в безопасности!

Статья доктора Майкла Дж. Гарбаде, генерального директора Образовательной экосистемы

Jeffrey Wilson Administrator
Sorry! The Author has not filled his profile.
follow me
    Like this post? Please share to your friends:
    Adblock
    detector
    map